La Facultad de Farmacia fue creada en 1919, siendo la primera Escuela de Farmacia del país. El 17 de marzo de 1919, el profesor Salvador Gálvez Rojas dictó la primera clase de Química a 28 alumnos del primer curso de Farmacia. Hasta 1928 la duración del pregrado era de tres años; entre 1929 y 1944 aumentó a cuatro, y en 1945 a cinco años. Hasta 1945 el título era de Farmacéutico y posterior a ello cambió a Químico-Farmacéutico. En 1974 el título era otorgado por la Universidad de Chile, sin embargo ese año se faculta a la Universidad de Concepción para conferir los títulos de Químico-Farmacéutico y de Bioquímico.
La Facultad de Farmacia en la actualidad cuenta con las carreras de Química y Farmacia (1919), Bioquímica (1957), y Nutrición y Dietética (1975).